교육연구단에는 다음과 같은 4개의 연구팀을 둔다. 각 팀의 팀장은 단장이 지명한다.

- 제 1 연구팀: 선형 및 비선형 해석학적 구조

- 제 2 연구팀: 대수적 구조와 표현론 및 그 응용

- 제 3 연구팀: 기하, 위상과 그 동역학적 구조

- 제 4 연구팀: 응용해석과 과학계산